| English | Arabic | Home | Login |

Conference

2021

The role of Ezh2 and Tks4 in EMT-related processes

2021-11
Hungarian Life Sciences Conference
Epithelial-mesenchymal transition (EMT) is a process where the epithelial cells acquire mesenchymal properties by repressing cell–cell junction and losing cell-cell interactions and gaining a more migratory phenotype. The first step in the metastasis formation of cancer is EMT. EMT is involved in different physiological and pathological processes such as embryogenesis, inflammation, wound healing, and cancer metastasis. Various factors have been involved in the regulation of EMT, these include different transcription factors (TFs), several small and long non-coding RNAs, epigenetic modulators and exogenous inducers [1]. Enhancer of zeste homolog 2 (Ezh2) is a histone lysine methyltransferase responsible for the activity of Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2). Ezh2 is responsible for the maintenance of the trimethylated lysine 27 on histone H3 (H3K27me3) [2]. Tyrosine kinase substate 4 (Tks4) belongs to the family of scaffold proteins that is tyrosine phosphorylated by EGFR pathway through Src kinase. It is a protein product of SH3PXD2B gene. Tks4 is characterized by a PX domain and four Src homology 3 domains [3]. Tks4 is closely related to Src substrate adaptor proteins that are required for podosome formation, cancer cell invasion and tumor growth [4]. In humans, the Tks4 deficiency is responsible for the development of Frank-ter Haar syndrome. According to our previous study, the absence of Tks4 induces EMT like changes [5]. In this study, we demonstrated that the EZH2 is involved in the EMT like change in Tks4 deficient cells.

The RBR-polyQ Region Of KMT2D: Unique Sequence-Specific Function

2021-11
Hungarian Life Sciences Conference
Proteins with large intrinsically disordered regions are the second most common drivers of liquid phase separation, and the lysine methyl transferase KMT2D (also known as mixed lineage leukemia 4; MLL4) contains intrinsically disordered regions up to 70% of its full length. KMT2 proteins are responsible for the mono-and di-methylation of histones at enhancers, and tri-methylation of histone H3 lysine 4 (H3K4) at active promoters. According to our previous studies, KMT2D is capable of lncRNA binding, but the molecular background and the physiological relevance of this binding are obscure. As some lncRNAs play their role as molecular scaffolds to enroll chromatin regulators in the formation of membraneless biomolecular condensates and allocate their enzymatic activities to proper locations in the genome to influence the expression of target gene, it is possible that the lncRNA binding of KMT2D is important in its regulation and targeting.
2015

Kanser hücrelerinde non-coding LINC00663 RNA’nın yeni splice varyantlarının belirlenmesi ve bu splice varyantlarınpotansiyel ikincil yapılarının gösterilmesi

2015-10
XIV. ULUSAL TIBBİ BİYOLOJİ VE GENETİK KONGRESİ
Long noncoding RNA (lncRNA)’lar son yıllarda tüm genom ve transkriptom sekanslama yöntemlerinin gelişmesi ile bilim dünyasında ilgi odağı haline gelmişlerdir. Son yıllarda yapılan çalışmalar ile lncRNA’ların birçok biyolojik fonksiyonu ortaya konmuş ve bu RNA moleküllerinin deregülasyonu kanser başta olmak üzere birçok kompleks hastalık ile ilişkilendirilmiştir. Long intergenic non-protein coding RNA 663 (LINC00663) 19. Kromozomda yerleşiktir ve bu zamana kadar papiller tiroid karsinom haricinde hiçbir patoloji ile ilişkilendirilmemiştir. Bu çalışmada LINC00663’ün farklı insan dokularda ve aynı zamanda farklı kanser hücre hatlarında ekspresyon profilinin belirlenmesi amaçlanmıştır.
2014

Çeşitli İnsan Dokuları ve Hücre Hatlarında non-coding LINC00663 RNA’nın Gen İfade Profili

2014-09
TIBBI GENETİK KONGRESİ
Long noncoding RNA (lncRNA)’lar son yıllarda tüm genom ve transkriptom sekanslama yöntemlerinin gelişmesi ile bilim dünyasında ilgi odağı haline gelmişlerdir. Son yıllarda yapılan çalışmalar ile lncRNA’ların birçok biyolojik fonksiyonu ortaya konmuş ve bu RNA moleküllerinin deregülasyonu kanser başta olmak üzere birçok kompleks hastalık ile ilişkilendirilmiştir. Long intergenic non-protein coding RNA 663 (LINC00663) 19. Kromozomda yerleşiktir ve bu zamana kadar papiller tiroid karsinom haricinde hiçbir patoloji ile ilişkilendirilmemiştir. Bu çalışmada LINC00663’ün farklı insan dokularda ve aynı zamanda farklı kanser hücre hatlarında ekspresyon profilinin belirlenmesi amaçlanmıştır.

Back